Харківський національний університет Повітряних Сил є постійним організатором наукових конференцій, семінарів та конкурсів наукових праць Всеукраїнського масштабу. Вже 12 років поспіль, університет організовує та проводить наукову конференцію “Новітні технології – для захисту повітряного простору” за участю представників Міністерства оборони України, Генерального штабу Збройних Сил України, Командування Повітряних Сил Збройних Сил України, військових частин, науково-дослідних установ, навчальних закладів, організацій та підприємств промисловості України. Метою конференції є обмін науковою інформацією з питань розвитку, застосування та забезпечення Повітряних Сил Збройних Сил України, удосконалення їх системи управління, розвитку та бойового застосування озброєння і військової техніки в інтересах захисту повітряного простору держави з урахуванням досвіду АТО.
Щорічно проводяться також наукова конференція слухачів, курсантів та студентів Харківського національного університету Повітряних Сил імені Івана Кожедуба, воєнно-історична конференція, науково-практична конференція присвячена до Дня науки.
Наукові конференції та семінари, які проводяться в університеті є складовою наукового забезпечення реалізації відповідних заходів щодо формування нового обрису Збройних Сил України, що має відповідати вимогам сучасності. Минулого року це були:
- семінар “Можливі шляхи вирішення проблемних питань оснащення Збройних Сил України новітніми безпілотними авіаційними комплексами”;
- науково-практична конференція “Можливі шляхи удосконалення законодавчих та нормативно-правових документів з питань застосування безпілотних авіаційних комплексів в повітряному просторі України”;
- науково-практична конференція з питань реформування системи вищої військової освіти, де було визначено шляхи подальшого вдосконалення навчального процесу та наукової діяльності в університеті за досвідом АТО;
- семінар “Встановлення можливості вітчизняних підприємств щодо створення (розроблення) зброї (елекромагнітної) на нових фізичних принципах”;
- науково-практична конференція Харківського національного університету Повітряних Сил імені Івана Кожедуба “Високоточні багатоцільові комплекси ракетного і реактивного озброєння повітряного та наземного базування“.