Анотація: В работе рассматривается метод синтеза дерева решений при комплексной оценке рисков на этапах диагностики и медицинской реабилитации в системах информационной поддержки лица принимающего решения. Рассмотрены основные этапы обработки данных. Отмечено, что при синтезе бинарного дерева решений методом иерархической кластеризации диагностируемых состояний в признаковом пространстве, минимизируются только ошибки этапа диагностики. Для минимизации комплексной ошибки обоих этапов в работе предлагается перейти из признакового пространства в пространство фармакологических действий и выполнять иерархическую кластеризацию в указанном пространстве. Для этого разработаны необходимые метрика и критерий кластеризации.